(1)村卫生室及村中心卫生室就诊报销60%，每次就诊处方药费限额10元，卫生院医生临时补液处方药费限额50元。
(2)镇卫生院就诊报销40%，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额100元。
(3)二级医院就诊报销30%，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额200元。
(4)三级医院就诊报销20%，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额200元。
(5)中药发票附上处方每贴限额1元。
(6)镇级合作医疗门诊补偿年限额5000元。
2、住院补偿
(1)报销范围：
A、药费;辅助检查：心脑电图、X光透视、拍片、化验、理疗、针灸、CT、核磁共振等各项检查费限额200元;手术费(参照国家标准，超过1000元的按1000元报销)。
B、60周岁以上老人在镇卫生院住院，治疗费和护理费每天补偿10元，限额200元。
(2)报销比例：镇卫生院报销60%;二级医院报销40%;三级医院报销30%。
3、大病补偿
(1)镇风险基金补偿：凡参加合作医疗的住院病人一次性或全年累计应报医疗费超过5000元以上分段补偿，即5001-10000元补偿65%，10001-18000元补偿70%。
镇级合作医疗住院及尿毒症门诊血透、肿瘤门诊放疗和化疗补偿年限额1.1万元。
报销程序
一、报销所需资料
1、门诊报销携带资料：门诊发票、合作医疗证历本(或病历)。
2、住院报销携带资料：住院发票、合作医疗证历本(或病历)、费用明细清单、出院小结、其它有关证明。
3、门诊特殊病报销携带资料：门诊发票、特殊病种合作医疗证历本。
4、办理特殊病种携带资料：特殊病种门诊治疗建议书，合作医疗证历本、病历、有关化验报告单、照片二张。
二、报销流程：
参保户将报销所需资料备齐后交村(社区)合作医疗联络员，由村(社区)合作医疗联络员审核后报镇合作医疗联络员，再由镇联络员送区农医办结报中心进行报销。
新型农村合作医疗报账指南
住院报账程序：
医院直接报账：
因疾病住院办理住院手续时，向医院出具新型农村合作医疗证直接参与报账。
镇新型农村合作医疗办公室报账：
所需材料：出院证、正式发票、费用清单、户口本、身份证、农村合作医疗证。
外地住院，还需备齐：住院小结、住院首次病程记录、出院记录。
区外住院，还需备齐：入院记录、出院记录。
外伤住院，还需备齐：外伤证明、入院记录。
(外伤证明由所在村社开具详细证明，并盖村委公章)
生育住院：
本地住院正常分娩，需：出生证明、准生证。
外地住院正常分娩，需：出生证明、准生证、入院记录、出院记录。
剖腹生产(本地、外地)，需材料：出生证明、准生证、入院记录、出院记录。
特殊门诊的办理：
延伸阅读：
陕西传媒网讯(陕西日报记者程伟)为保障陕西省贫困人口享有基本医疗卫生服务，防止因病致贫返贫，确保2020年农村贫困人口实现脱贫，省卫生计生委、省扶贫办近日联合下发了《陕西省健康扶贫实施方案》，陕西省2017年新型农村合作医疗将在上年度住院费用基础上，提高5个百分点;城乡居民大病保险首段起付线降低50%。
根据《实施方案》，未来5年，陕西省将不断提高贫困地区医疗保障水平，新型农村合作医疗和城乡居民大病保险制度将覆盖所有贫困人口，新型农村合作医疗门诊统筹覆盖所有贫困县。农村特困供养人员参加新型农村合作医疗个人缴费部分财政全额资助，农村低保对象参加新农合个人缴费部分财政给予定额补贴。将扩大农村贫困残疾人基本医疗保险报销范围，在已有9项残疾人医疗康复项目基础上，将康复综合评定等20项医疗康复项目纳入基本医疗保险报酬范围。
《实施方案》规定，实行县域内农村贫困人口先诊疗后付费的结算机制。陕西省将在县级医疗机构设立“一站式”综合服务窗口，实现基本医疗、大病保险、医疗救助和社会慈善救助“一站式”信息交换和即时结算服务。同时还将为农村贫困人口开展签约服务。以县为单位，优先为农村贫困人口每人建立1份动态管理的电子档案和1张服务功能较完善的健康卡，推动贫困家庭与乡村医生或乡镇卫生院医生签约服务。
《实施方案》要求，未来5年，陕西省将按照“填平补齐”原则，加强贫困地区县级医院、乡镇卫生院、村卫生室标准化建设，使每个贫困县达到每县至少有1所二级甲等公立医院，每乡镇有1所政府举办的标准化乡镇卫生院，每村有1个规范化卫生室。同时我省还将建立三级医院一对一帮扶贫困县机制，向贫困县县级医院派驻一名院长或副院长和至少5名中高级医务人员驻点帮扶。
为强化贫困地区医疗卫生人才培养，陕西省将为贫困地区县乡医疗卫生机构订单定向免费培训医学类本科生。县镇医疗卫生机构专业人员5年内每人接受半年以上培训，提高技术水平，到2020年实现基层医疗机构每万人口至少有2名全科医生。分期分批轮训乡村医生，5年内每名乡村医生接受3个月以上培训，到2020年每个村至少有1名达到中等医学专业毕业水平的乡村医生。