学霸们教你判断反转录第一链cDNA合成是否成功探针cdnapcr扩增

cDNA在反转录界一直大名鼎鼎,但TA鲜少抛头露面!那我们怎样才能辨别出TA的身份呢?按理来说,RNA的质量没问题(28s和18srRNA清晰、明显,亮度比符合2:1),那么反转录产生的cDNA一般是不会出现问题的。但是偏偏有那么些个博学多才、才高八斗的抖机灵们想要一探究竟!

终于,作为2G冲浪选手,小编我也机灵了一回(上辈子积德)。

和小编一起来听听学霸们怎么说?

一号学霸

一般可以用电泳检测是否合成适当大小片段的条带,这方法看cDNA大小没问题(自信);如果想看碱基那当然还是测序或者使用探针检测,就是比较麻烦(一如既往的自信)

二号学霸

三号学霸

用PCR检测合成的cDNA中管家基因的量,如果出现比较清晰的条带,基本可以证实你的cDNA没有问题,我们实验室一直这样控制(众人)。

如果不怕烦的话,可以在反转录第一链时加入少量同位素标记的dNTP,然后看一下放射比活度或做个放射自显影(别出心裁)。

四号学霸

五号学霸

首先看你用什么方法合成cDNA,如果随机引物合成,三号的建议可以考虑(因为管家基因片段多数较短)。如果是LDPCR,则这些内参可能无法检验结果的好坏(有条有理)。

dscDNA检测我倒是做过(LDPCR),理论上由总RNA起始的,哺乳动物应该1.2%浓度的琼脂糖凝胶于0.4~6kb有明显的smear,且有一些明显的亮带(脑、脾、胸腺除外)(过来人代表)。

六号学霸

七号学霸

做内参对照啊!如GAPDH,β-actin,β-MG等(言简意赅)。

.........(好多学霸,真好!)

这么多学霸出谋划策,你,懂了吗?

为了防止有人和小编一样可爱,英语、术语分不开,我先来解释一下:

Smear:小编查了是弥散带的意思

LDPCR:全称LongDitancePCR即长片段PCR

dscDNA:指依靠DNA聚合酶,与cDNA相互补的第二链cDNA

dNTP:脱氧核糖核苷三磷酸

那小编给大家做了总结,汇报如下,请各位霸霸查收~

选择试剂盒:您做反转录实验想得到什么样的产物呢?

产品试用福利

StarScriptIIcDNA第一链合成预混试剂

如何检测第一链cDNA合成成功?

(一)cDNA电泳检测(大多数学霸推荐,简单快速,但需注意特殊情况)

取约5ul反应产物,在1%琼脂糖凝胶上电泳,EB染色,紫外成像检测,呈现出大小在200~10Kb的条带,其中重心区域在1~4Kb之间,这说明反转录完全,得到了高质量的cDNA(如果RNA丰度低,电泳也可能是无产物,但是这种情况不代表PCR会无结果)。

(二)cDNA测序(受限较多,但结果精准)

全长双链cDNA做分子克隆实验,然后通过测序结果精确判断。

1)Oligo(dT)18和RandomPrimers按比例使用可解决poly(A)mRNA模板限制和长度限制的问题

2)序列特异性引物可获得目的序列

(三)探针检测(相对较麻烦,但结果较精准)

qPCR或RT-qPCR步骤

(四)管家基因/内参基因(引物类型限制,适用范围受限)

以反转录产物为模板,扩增内参基因,扩增有结果,说明cDNA的质量基本可以保证,这个方法限制于随机引物扩增(因为管家基因片段多数较短)。

而Oligo(dT)18与序列特异性引物扩增或做LDPCR(2kb、10kb等长片段)检测时,这些内参扩增的几率远大于全长或大片段cDNA的扩增,这时可能就无法通过内参来检验cDNA扩增结果的好坏。

(五)同位素标记

反转录中加入少部分同位素标记的dNTP,做放射比活度或放射自显影检测。

THE END
1.Kotlin中级篇(六):数据类(data)密封类(sealed)所谓受限的类继承结构,即当类中的一个值只能是有限的几种类型,而不能是其他的任何类型。 这种受限的类继承结构从某种意义上讲,它相当于是枚举类的扩展。但是,我们知道Kotlin的枚举类中的枚举常量是受限的,因为每一个枚举常量只能存在一个实例。若对Kotlin中的枚举类不甚了解的,请参见我的另一篇文章Kotlin——中https://www.jianshu.com/p/c5ba40150d91
2.JAVA语言程序设计(进阶篇)第十版十九章课后题为什么Java中允许使用原始类型? 因为在实际执行语句时,java在虚拟机中是没有泛型的,会将泛型转化为一个参数类型的强制转换,执行语句是原始类型。 什么是非受限通配?什么是受限通配?什么是下限通配? 非受限通配是 ?,即?Extends object,等级在object之下; 受限通配是 ? Extends E,即 ?是E的子类或是E; 下限通配是https://blog.csdn.net/m0_67393413/article/details/126033065
3.监管规则适用指引——审计类第1号注册会计师以无法获取充分、适当的审计证据为由,对应识别的财务报表整体重大错报不予识别,规避作出恰当的职业判断,从而发表“受限”而非“错报”类型的审计意见。特别是在涉及专业判断、会计估计的领域,如合并范围、资产减值(尤其是商誉减值)、预计负债、款项可收回性等,存在较多以“受限”代替“错报”类型审计意见的https://www.shui5.cn/article/2a/15594.html
4.万兴数据管家正式上线,一键恢复和备份微信聊天记录!3.备份的数据类型会受限,部分数据不能备份; 以上就是最好用的微信数据备份的方法,其中方法一可以备份多种数据,自己独立操作,不用担心个人隐私泄露,而且是永久保存在本地,避免微信聊天记录再次丢失。以后,大家可以保存微信中重要的商业信息,或者自己男/女友的聊天记录。 https://www.admin5.com/article/20211019/1005734.shtml
5.免费客户管理系统(好用的免费CRM客户管理软件)白码CRM客户管理系统通过对客户进行全方位、多角度的跟进管理和数据分析。从而提高销售线索转化率,实现业绩增长。 免费试用 免费客户管理系统大致有两种类型,一种是免费但受限的(也叫做免费增值模式),另外一种则是开源软件。因此免费但受限的软件会对免费用户数量、联系人、存储空间、额外功能中的一种或几种进行限制。https://www.bnocode.com/article/crmbk599.html
6.环境安装类问题FAQ分析服务受限数据类型 自定义数据类型 活动类型常量 版本更新说明 应用开发 客户端开发(Android) 简介 开发流程 开发准备 注册帐号及申请服务 集成HMS Core SDK 配置混淆脚本 修改包名、导入证书指纹 登录并申请权限 DataController 开发 SensorsController 开发 AutoRecorderController 开发 ActivityRecordsCohttps://developer.huawei.com/consumer/cn/doc/development/HMS-Guides/Environment_installation